分子动力学模拟

分子动力学模拟

2024/10/23     浏览次数:    

分子动力学模拟

分子动力学模拟技术原理简介

  分子动力学(Molecular Dynamics,MD)模拟是一套分子模拟方法,,该方法主要是依靠牛顿力学来模拟分子体系的运动,,,在由分子体系的不同状态构成的系统中抽取样本,,计算体系的热力学量和其他宏观性质。。。。引入量子力学方法后,,,可将研究领域进一步扩展到反应机理的研究。。。


适用范围

  分析配体-受体复合物体系的相互作用机制:相互作用模式、、诱导契合效应、、蛋白骨架运动;
  预测活性小分子的结合自由能,,,阐明机理或指导结构改造;
  优化蛋白结构,,,,如对同源模建得到的结构进行结构优化。。

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